Jakomäenkallio on Helsingin korkein luonnollinen kohta.  Viimeisimmän jääkauden väistyessä jään sulaessa.. Jakomäenkallio on Helsingin korkein luonnollinen kohta.  Viimeisimmän jääkauden väistyessä jään sulaessaja vesien virratessa suureksi osaksi nykyisen Itämeren alueen rajoja noudattaneeseen muinaiseen Yoldian-mereen, Jakomäenkallio oli nykyisen Helsingin alueelta ensimmäinen merenpinnan yläpuolelle yltänyt maa-alue. Tästä ajanjaksosta rantana muistuttaa Jakomäenkallion rantakivikko.